Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2SURPO15042 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms