Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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