Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms