Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM229AB2RXF0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM229AB2RXF0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms