Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms