Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms