Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4BQ9Y4P1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms