Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms