Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms