Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP1Q9UPQ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP1Q9UPQ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms