Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms