Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms