Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms