Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms