Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms