Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms