Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms