Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms