Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTLNQ9NXG0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTLNQ9NXG0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms