Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms