Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms