Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms