Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms