Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms