Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms