Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms