Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms