Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms