Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NUP88Q99567 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms