Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAP3Q96P50 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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