Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SENP8Q96LD8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms