Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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