Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms