Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms