Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIPC3Q8TF64 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIPC3Q8TF64 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms