Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A9Q8NBW4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms