Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms