Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms