Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms