Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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