Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
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