Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms