Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms