Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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