Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms