Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL13BQ3SXY8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL13BQ3SXY8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms