Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms