Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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