Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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