Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TAF11Q15544 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TAF11Q15544 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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TAF11Q15544 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TAF11Q15544 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
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TAF11Q15544 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TAF11Q15544 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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